يقوم القسم بعلاج مرضي الأورام ( المدنيين والعسكريين) وذلك تحت اشراف الأطباء و الاستشاريين بالقوات المسلحة بالاضافة الي نخبة من أفضل أساتذة علاج الاورام بكلية الطب بجامعة الاسكندرية كما يقدم القسم العلاج الاشعاعي وذلك باحدث التقنيات المعروفة عالميا ثلاثي الابعاد ومتغير الشدة والعلاج بالقوس الاشعاعي (3D , IMRT , VMAT ) وذلك باستخدام احدث اجهزة العلاج الاشعاعي